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生信技工 - 用k-mer分析進行基因組調查:(二)用jellyfish進行k-mer頻數統計

(全文約1520字) 【推薦】用Smudgeplot評估物種倍性後,用組合jellyfish+GenomeScope1.0做二倍體物種的基因組調查,用組合KMC+GenomeScope2.0做多倍體物種的基因組調查。 1. k-mer進行基因組調查的軟件 k-mer進行基因組調查分為k-mer頻數統計和基因組特徵評估兩步。 jellyfish可以實現第一步k-mer頻數統計。 jellyfi

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