之前在《一文了解GO/KEGG功能富集分析》裏，我們已經聊過 GO 和 KEGG 的核心概念，還給大家推薦了 DAVID 這個實用工具～

   

Step1：進入 DAVID 分析頁面

1. 打開 DAVID 官網：https://david.ncifcrf.gov/（若網頁加載異常，可刷新重試或檢查網絡）
2. 點擊左側功能菜單中的「Functional Annotation」

   

進入分析主頁面，紅框標註區域就是核心操作區啦～

        

Step2：三步完成基因列表提交與分析啓動

核心流程：提交基因列表 → 選定基因類型 → 確認並提交具體操作如下：

1. 在「Enter Gene List」框中上傳基因列表，格式要求每行一個基因，且總數量不超過 3000 個；
2. 點擊「Select Identifier」下拉菜單，選擇基因類型 —— 咱們上傳的是基因名（Gene Symbol），所以找到並勾選「OFFICIAL_GENE_SYMBOL」（菜單較長，耐心找找哦）；
3. 「List Type」選項中，直接選中「Gene List」單選框；
4. 點擊「Submit List」提交即可。

提交後等待幾秒，若彈出提示「Please note that multiple species have been detected in your gene list.」，説明基因列表中檢測到多個物種 —— 點擊「確定」後，在「List」中選中目標物種（此處以「Homo sapiens」為例），再點擊下方「Select Species」就能繼續啦～

     

Step3：查看核心分析結果

操作完成後，就能看到完整分析結果頁啦！紅框裏的摺疊欄，分別對應 GO（包含 BP、CC、MF 三大類 —— 忘了它們的含義？可以回頭看看《3 分鐘瞭解 GO/KEGG 功能富集分析》補補課～）和 KEGG 的分析結果，一目瞭然～

Step4：提取關鍵結果並下載

做完分析，下一步就是提取目標結果、準備可視化啦！具體操作看這裏：

1. 結果頁中，「Gene_Ontology (3 selected)」摺疊欄下，藍框標註的「GOTERM_BP_FAT」「GOTERM_CC_FAT」「GOTERM_MF_FAT」，就是我們需要的 GO 功能富集結果；
2. 「Pathways (3 selected)」摺疊欄裏，藍框的「KEGG_PATHWAY」就是 KEGG 的核心結果；
3. 想查看每個類別（BP/CC/MF/KEGG）的詳細數據？點擊對應欄目後的「Chart」按鈕（綠框所示）就行～

點擊「Chart」後，會顯示包含多列數據的詳細結果表，核心關注這幾列：

• 關鍵列：Term（GO/KEGG 功能術語）、P-Value（統計顯著性）；
• 輔助列：Count（富集的基因數量）、%（富集基因佔比）。

想下載結果？點擊紅框中的「Download File」，會彈出一個純文本格式的結果頁（看似雜亂但數據完整），直接下載或導入作圖軟件，就能進行後續分析啦～

 

Step5：結果導出與可視化

各位科研小夥伴看文獻時，肯定見過不少功能富集分析的圖吧？柱狀圖、高級氣泡圖是不是很常見？還有人在用 Excel、PPT 慢慢作圖嗎？

下面這種高顏值、高專業度的圖，是不是正是你想要的？